影片以1945為時代背景，所謂“暴風女神”就是日本潛水艇伊507號上配置的尖端探測系統，當時美國向日本廣島投下原子彈，第二次世界大戰已經接近尾聲。

日本方面為了防止美國再次使用原子彈攻擊，而制定下了反擊計劃，意圖摧毀美軍的原子彈發射基地。

海軍上校淺倉奉命執行，而他手中的王牌就是由德國制造，具有最先進攻擊力的戰斗潛水艇“伊507”，淺倉將與年青部下絹見少校一起為扭轉戰爭局勢而做著最后的殊死努力。